Matías Córdoba nació el 16 de abril de 1999 y realizó las divisiones inferiores en Gimnasia de Jujuy, Club en el cual debutó como profesional en la Temporada 2018/2019.
Con la camiseta del conjunto Jujeño, disputó 35 partidos y anotó 7 goles.
En septiembre del 2020, Córdoba se sumó a la Institución y ahora continuará su carrera hasta diciembre de este año en Deportivo Morón a préstamo sin cargo y sin opción.